為獎勵醫護人員防疫辛勞，衛福部於疫情期間端出每人每日一萬元的津貼，另外也有針對急救責任醫院的防疫獎勵，當下醫護人員都相當感佩，也很幸運的全國上下同心協力，讓我們取得對抗病毒的階段性成果。但時隔數月，會員卻反映，1–3月的津貼至今尚無下落，工會為保障會員權益，也對這筆津貼進行追蹤。
根據醫事司說法，「七月上旬」會撥付3.2億元的「醫護人員及感控人員津貼」（1–3月份），健保署也會在「七月上旬」撥款6.875億元的「急救責任醫院防疫獎勵」(1–6月份）。【附件一】但根據本會會員回報，截至今日，台大、北榮、新光、萬芳、國泰醫院的醫師皆尚未領到。
為釐清究竟是撥款過程阻礙，或是醫院尚未發放，工會於7/9致電追蹤，醫事司卻僅回應：「已經發出幾間醫院了」，但對於哪些醫院已經發放、哪些醫院尚在補件，衛福部則表示：「無可奉告」，迄今尚未給予回覆，也讓我們追蹤上遭遇困難。
根據6/25醫事司新聞稿，「醫護人員及感控人員津貼」已有20間醫院完成申請，另有89間正辦理補件作業；而「急救責任醫院防疫獎勵」更是不待醫院遞交複雜申報資料而撥款。目前大多數醫院的醫師會員尚未領取該筆獎金，工會特別關切究竟是政府遲發，或是醫院發放流程卡關。
獎勵金發放也不宜一拖再拖，若連1–3月的津貼都還沒完成，加上目前已經開始申報的4–6月津貼申請程序，恐怕對行政單位而言更加曠日廢時，不知何時能夠發放完畢。工會建議除盡速撥款，也公告已經發放醫院名單，如此一來我們也才能督促醫院補足申請所需資料，以及監督醫院落實核發，避免在發放過程中產生發放爭議。
過去類似事件，例如八仙塵爆獎勵金，也曾發生撥款不乾脆、事後追討、駁回申請的狀況，引起醫護人員諸多不滿。現在還來的及，目前已屆7月中旬，距離衛福部所承諾時間已然遲到，醫護人員沒有時間隨時緊盯荷包，最後一哩路，懇請政府千萬別讓防疫爛尾。
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