自五月中本土疫情爆發以來，國內有至少27間醫院傳出有醫護確診新冠肺炎消息，但隨著案例激增，清楚的足跡疫調困難重重，許多醫院都傾向認定醫護染疫是來自社區而非院內感染，也缺乏明確的證據顯示感染COVID-19與照護工作有直接因果關係。在現今尚無明確職業病認定指引的情況下，醫護人員若想申請補助，還必須先經過醫院同意，醫護工會直指現行規定顯然不合理。
自今年初部立桃園醫院群聚感染事件後，政府修改《執行第五類傳染病防治工作致傷病或死亡補助辦法》，將因公染疫的補助金額上限調高到100萬，而上個月中央疫情指揮中心更曾於記者會上明白表示，對於補助發放會從寬認定，且「不是醫院說了算」。
但工會質疑，現行制度明顯還是「醫院說了算」。細看《執行第五類傳染病防治工作致傷病或死亡補助辦法》當中提到應檢附的文件，其中便有一項為「相關單位出具係因執行防治工作致感染第五類傳染病之證明文件」（見附件一），相當於染疫醫護必須經過服務醫院的同意才能申請因公染疫補償。
臺大醫院企業工會表示，以臺大醫院為例，就有第一線的醫護人員，平時不是在工作單位就是待在醫護宿舍，依然被感管中心判斷為社區感染，至今無法取得前述之證明文件。在上述的文件裡，機構必須詳述是在哪個工作單位染疫，還得要證明員工已經做好防護措施依然染疫，工會憂心，醫院可能基於各種理由，迴避認定工作場所的接觸，甚至將染疫責任推給員工未盡防護責任。
臺北市醫師職業工會表示，雖然中央疫情指揮中心表示將會放寬採認，讓染疫醫護盡量可以領取補助，但政府單位似乎忘記了，要讓染疫醫護的資料呈到有關部門審核之前，還得經過醫院這一關，若是醫院有心阻撓，或是因為行政怠惰沒有積極協助，對於因公染疫醫護顯有不公。
臺北市醫師職業工會暨臺大醫院企業工會共同呼籲，政府應直接修改現行補助申請原則，採用「機構核轉」及「個人申請」雙軌制，讓染疫人員就算不經醫院同意，依舊能夠提出申請。工會也建議，疾管署在認定是否因公染疫的標準上，應該盡可能「從優從寬」，認定有難度的個案，可參酌職業醫學科的職業傷病認定，確保因公染疫的醫護警消、防疫人員皆能獲得相關補償。
【7/8 07:33PM補充】
★本會今日（7/8）與臺大醫院企業工會共同發布新聞稿！獲得陳時中部長及 羅一鈞副署長回應，記者會2分鐘👉完整片段公開！
檢附的文件有包括出具「相關單位提供的染疫的證明文件」，假如因為特殊情形，醫院不願意幫染疫醫護開立，或已經誠實回報疫調，但仍無法從衛生單位取得證明或檢具相關文件，只要在申請書敘明理由，政府在收到申請書後，會再幫忙協助相關文件調閱，免去醫護要自行證明係因公染疫的困擾。
工會建議主管機關所提供「相關單位提供的染疫的證明文件」之範本，加入「相關單位不願提供」這個選項，並附註說明不影響申請程序！
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